1. Įvairūs apšvietimo šaltiniai
Mikroskope naudojamas apšvietimo šaltinis yra elektronų pistoleto skleidžiamas elektronų srautas, o optinio mikroskopo apšvietimo šaltinis yra matoma šviesa (saulės šviesa arba šviesa). Kadangi dalinio srauto bangos ilgis yra daug trumpesnis už šviesos bangos ilgį, elektroninio mikroskopo padidinimas ir skiriamoji geba yra žymiai didesni nei šviesos veidrodžio. .
2. Skirtingi lęšiai
Elektroniniame mikroskope didinamas objektyvas yra elektromagnetinis lęšis (žiedo formos elektromagnetinė ritė, galinti generuoti magnetinį lauką centre), o optinio mikroskopo objektyvas – iš stiklo pagamintas optinis lęšis. Elektroniniuose mikroskopuose yra trys elektromagnetinių lęšių grupės, kurios prilygsta kondensatoriaus objektyvo ir okuliaro funkcijoms optiniuose mikroskopuose.
3. Skirtingi vaizdavimo principai
Elektroniniame mikroskope tikrinamą mėginį veikiantis elektronų spindulys padidinamas elektromagnetiniu lęšiu, o tada atsitrenkia į fluorescencinį ekraną vaizdams arba veikia šviesai jautrią plėvelę. Elektronų tankio skirtumo mechanizmas yra tas, kad kai elektronų pluoštas veikia bandinį, kurį reikia ištirti, krintantys elektronai susiduria su medžiagos atomais, kad susidarytų sklaida, o skirtingos mėginio dalys turi skirtingą elektronų sklaidos laipsnį. todėl mėginio elektroninis vaizdas pateikiamas atspalviais. Mėginio objekto vaizdas optiniame mikroskope pateikiamas su ryškumo skirtumu, kurį sukelia skirtingų mėginio struktūrų sugertos šviesos kiekio skirtumas.
4. Rezoliucija
Dėl šviesos trukdžių ir difrakcijos optinių mikroskopų skiriamoji geba gali būti apribota tik iki 02-05um. Kadangi elektroniniai mikroskopai naudoja elektronų pluoštus kaip šviesos šaltinius, gedimo greitis gali siekti nuo 1 iki 3 nm. Todėl optinių mikroskopų audinių stebėjimas priklauso mikronų lygmens analizei, o elektroninių mikroskopų audinių stebėjimas – nano lygmens analizei.
5. Lauko gylis
Paprastai optinio mikroskopo lauko gylis yra tarp 2-3um, todėl mėginio paviršiaus lygumas yra labai sudėtingas, todėl mėginio paruošimo procesas yra gana sudėtingas. SEM dvasia gali siekti kelis metrus, todėl nereikalaujama mėginio paviršiaus geometrijos lygumo, mėginio paruošimas yra gana paprastas, o kai kurioms geometrijoms mėginio paruošti nereikia. Stereo mikroskopai turi gana didelį lauko gylį, tačiau jų skiriamoji geba yra labai maža.
6. Naudojami įvairūs mėginių paruošimo būdai
Submikroskopiniam stebėjimui naudojamų audinių ir ląstelių mėginių paruošimo procedūra yra sudėtinga, sudėtinga ir brangi. Mėginių ėmimo, fiksavimo, dehidratacijos ir įterpimo etapuose reikalingi specialūs reagentai ir operacijos. Galiausiai, įterptus audinių blokus reikia įdėti į ultramikrotomą, kad būtų supjaustyti itin ploni 50–100 nm storio bandiniai. Šviesos mikroskopu stebimi mėginiai paprastai dedami ant stiklinių stiklelių, pavyzdžiui, įprasti audinių gabalėlių mėginiai, ląstelių tepinėlių mėginiai, audinių presuoti mėginiai ir ląstelių lašų mėginiai.
7. Didinimas
Efektyvus optinio mikroskopo padidinimas yra 1000X. Efektyvus gero elektrinio mikroskopo padidinimas gali siekti 1000 000X.
